農業金融機構之主管機關為行政院農業委員會,本局僅受行政院農業委員會委託對其辦理金融檢查,依「行政院暨所屬各機關處理人民陳情案件要點」第6點規定:「人民陳情案由陳情事項之主管機關受理;非屬收受機關權責者,應逕移主管機關處理」。有關農漁會信用部相關陳情案件請逕向行政院農業委員會(農業金融局)提出。